Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX29Q8TEQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms