Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms