Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF548Q8NEK5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF548Q8NEK5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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