Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC17Q8N6Y2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms