Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms