Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms