Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms