Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SV2AQ7L0J3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms