Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SSH2Q76I76 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSH2Q76I76 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSH2Q76I76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms