Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms