Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms