Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML4Q6UXN2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML4Q6UXN2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms