Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms