Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAF7Q6Q0C0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms