Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms