Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF40BQ6NWY9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF40BQ6NWY9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms