Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms