Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USPL1Q5W0Q7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms