Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms