Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM78BQ5VT40 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM78BQ5VT40 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM78BQ5VT40 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM78BQ5VT40 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM78BQ5VT40 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM78BQ5VT40 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM78BQ5VT40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM78BQ5VT40 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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