Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEND3Q5T5X7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms