Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms