Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN2Q52LD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms