Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRNQ4KMQ1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRNQ4KMQ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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