Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRY2Q49AN0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRY2Q49AN0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms