Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTN1Q16799 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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