Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B3Q16720 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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