Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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GABRA6Q16445 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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