Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F4Q16254 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F4Q16254 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms