Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNCBQ16143 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SNCBQ16143 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SNCBQ16143 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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