Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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ZNF56Q15929 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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