Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNHIT3Q15649 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms