Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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