Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDSNQ15517 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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