Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIX1Q15475 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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