Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B3Q15393 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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