Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF1Q15361 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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