Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK1Q15118 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDK1Q15118 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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