Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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