Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXOSC7Q15024 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms