Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLCA4Q14CN2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CLCA4Q14CN2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLCA4Q14CN2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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