Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMC1AQ14683 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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