Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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GBX1Q14549 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GBX1Q14549 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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GBX1Q14549 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GBX1Q14549 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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