Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SQLEQ14534 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms