Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM53BQ14153 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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