Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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