Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOFQ13790 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOFQ13790 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOFQ13790 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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