Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NAE1Q13564 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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