Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPF4BQ13523 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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