Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAD4Q13485 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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